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O BioMa — Programa de Monitorização da Biodiversidade Marinha da Madeira é um programa de longo prazo iniciado em 2016 na ilha do Porto Santo, no contexto da monitorização do recife artificial CORDECA, e posteriormente alargado à ilha da Madeira, em 2018. Atualmente, abrange 19 locais costeiros distribuídos pelas duas ilhas, representando cinco tipos de habitat — recifes rochosos, enrocamentos, naufrágios, fundos arenosos e bancos de rodólitos — e diferentes regimes de proteção. A monitorização é realizada duas vezes por ano, no verão e no outono.

O programa utiliza censos visuais subaquáticos padronizados para caracterizar as comunidades de peixes e macroinvertebrados móveis, complementados por fotoquadrados destinados à avaliação das comunidades bentónicas sésseis. Em 2026, foi ainda integrada uma componente ambiental baseada em perfis CTD, permitindo relacionar a biodiversidade observada com as características da coluna de água. Ao produzir séries temporais consistentes sobre a distribuição, abundância e composição de mais de 150 espécies, o BioMa fornece informação científica relevante para a investigação, a gestão das áreas marinhas protegidas e a avaliação do estado ambiental dos ecossistemas costeiros da Região Autónoma da Madeira.